BeeBee生信

Salmon 是转录本定量软件，使用转录本定量主要优点一是更准确，比如不同样本同一基因使用不同 isoform 此时基因长度并不相等，直接基因定量无法顾及；二是方便进行可变剪...

灵活胖子的进步之路

estimate包可以通过RNA-seq的数据来计算标本的免疫及机制评分，进而评估肿瘤的纯度，其原理通过特征的肿瘤的RNA-seq的signture来评估以上内容，其输入文件...

周运来就是我

所谓：操千曲而后晓声，观千剑而后识器。 作为一个开源软件，R的一个非常大的优点就是我们可以随意查看所有算法的源代码，在对这些源代码进行分析的过程中不仅可以加深对算法的认识，而...

佳名

1.读取基因表达数据 这是我的基因表达量数据 1.1提取部分数据集 1.2提取基因表达值所在的列，组成新的矩阵，并将矩阵转置 为什么要转置，参考https://www.jia...

BeeBee生信

序列比对是非常基础的工作，生物信息学分析大多涉及到这一步骤，虽然大部分人不做相关算法或软件的开发，但是了解总体的算法原理还是需要的。本文主要分为两部分。第一部分介绍简单的 2...

BeeBee生信

曾经我用 rMATS 进行可变剪切分析，现在我觉得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyzeR 功能总结如下。 In su...

PriscillaBai

整理思路：先画出中间的火山图，再画左右两张放大版的图，最后用AI将三张图拼接到一起，钢笔工具画出中间连接的小T形，同色的小矩形把连接处的实线盖住，打造出一种藕断丝连的神秘感（...

bioYIYI

一、 基础知识 1、 基因连锁： 基因连锁是指在有性生殖的减数分裂过程中，染色体上的DNA序列紧密结合在一起的倾向。 两个标记位点距离越近，在减数分裂过程中越不容易发生重组，...