中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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R语言ggplot2系列1-ggplot2简介
简单介绍一下ggplot2 既然要做“系列”当然要先介绍一下主角-ggplot2。ggplot2是一个十分强大的R语言可视化包。它的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图...
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第四步并不能将文件名转化为TCGA_IDs～
从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据
测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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如何用转录组数据定量肿瘤浸润免疫细胞有哪些方法可以用于评判肿瘤免疫浸润 方法很多，这里先选个简单一点MCPcounter，GEO和TCGA数据都可以分析，更重要的是因为包治百病=. = MCPcounter 加...
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TCGA数据下载-R包TCGAbiolinks下载数据
TCGAbiolinks 是一个用于TCGA数据综合分析的R/BioConductor软件包，能够通过GDC Application Programming Interfac...
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努力成为R 极客<br>R和python爱好者<br>bioninfomatics
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TCGA数据挖掘（3）：miRNA数据的下载本文的内容是用GDC下载并整理表达矩阵和临床信息数据。 1.从网页选择数据，下载manifest文件 数据存放网站：https://portal.gdc.cancer.gov...
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旨在传播生物医学科研实验技能和生物信息学基础知识及应用技巧，微信公众号：MedBioInfoCloud，博客：www.bioinfocloud.cn。
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套路分享：利用TCGA数据库进行免疫细胞浸润相关生信数据挖掘本文作者毛细血管，研究方向肿瘤学，目前主要在学习生信数据挖掘和肿瘤免疫微环境等，在后面的分享过程中主要分享自己学到的生信方面操作以及肿瘤免疫微环境相关的文献解读，现已发表me...
