无患子的邻里

请问稀有密码子有多少个才算多呢，会影响表达？

密码子优化

  在大肠杆菌中进行异源蛋白质的表达时，有时会发现重组蛋白质的表达量很低，给后面的分离纯化造成很大的困难。有些技术人员可能比较困惑，表达的蛋白质不是毒蛋白，载体是商用载体，一...

临窗听风雨

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无患子的邻里

你这个简直就是救命的，我的安装报错解决了

测序了，然后呢（四）有了OrgDb才能进行富集分析

刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类，OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系，以及基因与G...

刘小泽

30244 82 89

无患子的邻里 ·

再贴一条.
makeOrgPackage() 中必须要添加 maintainer
maintainer = "<yourname@domain.com>"
两侧的<>必须加上, 否则install.packages() 会报错, ## DESCRIPTION文件不对
其次 install.packages("***",repos=NULL, type = "sources")
有些版本的R要求指定type.

AntiAs 评论自测序了，然后呢（四）有了OrgDb才能进行富集分析

无患子的邻里

我在最后一步遇到了奇怪的问题，要奔溃了，能不能帮忙看看呢？文件第一列都没有问题，前面的代码都跑出来了
最后一步makeOrgPackage构建的时候
+ goTable = "go")
Error in .makeOrgPackage(data, version = version, maintainer = maintainer, :
The 1st column must always be the gene ID 'GID'

2022-07-09学习构建orgdb库

以下内容全部来自于此文章https://www.jianshu.com/p/f2e4dbaae719[https://www.jianshu.com/p/f2e4dbaae7...

房大喜

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无患子的邻里

@ShawnMagic 我在最后一步遇到了奇怪的问题，呀奔溃了，能不能帮忙看看呢？文件第一列都没有问题，前面的代码都跑出来了
最后一步makeOrgPackage构建的时候
+ goTable = "go")
Error in .makeOrgPackage(data, version = version, maintainer = maintainer, :
The 1st column must always be the gene ID 'GID'

构建自己物种的orgDb

1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下，同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py下载你所需要的数据库： egg...

多啦A梦的时光机_648d

9500 22 31

无患子的邻里

请问最后一步makeOrgPackage构建的时候有没有遇到这个报错啊?
+ goTable = "go")
Error in .makeOrgPackage(data, version = version, maintainer = maintainer, :
The 1st column must always be the gene ID 'GID'

构建自己物种的orgDb

1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下，同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py下载你所需要的数据库： egg...

多啦A梦的时光机_648d

9500 22 31

无患子的邻里

您好，请问我按照您的格式写了，之后报错无法打开文件ERROR: Failed to open file: /lustre/zywen/mj/MRM_WGS/MRM_leaf_RNA/MRMleaf-{S1-1..S1-3}_R1.fq.gz请问怎么解决呢

2020-01-23 【转录组】二、fastp 批量 质控及过滤

看来多核利用效率还可以 一对fastq质控时间在450秒～620秒之间，速度算快的了

my_derek

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