如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
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应该是最新最详细的MUMmer中文使用说明 -
vscode 下载安装，远程连接服务器，修改代码，免密登录vscode和远程插件下载链接：https://pan.baidu.com/s/1EuScRc6-GY0F16EzXXgM-A 提取码：6d8x 安装好后，按照下图导入远程插...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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我也是！好几天都没跑出来结果，程序一直在运行，不知道什么
SNP数据构建系统进化树
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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jbrowse centos安装过程
2019.04.19 jbrowse centos安装过程 安装apache 1.安装 yum -y install httpd 2.开启apache服务 systemctl...
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
