引言 methylKit是一个R软件包,用于分析和注释通过高通量亚硫酸氢盐测序获得的DNA甲基化信息。该软件包旨在处理RRBS及其变体的测序数据。但是,如果提供正确的输入格式...
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Cutadapt安装 基本命令 例子: 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters:adapter...
随机森林参数说明: 最主要的两个参数是n_estimators和max_features。 1.n_estimators:表示森林里树的个数。 理论上是越大越好,但是计算时间...
转载自:http://www.zilhua.com/629.html 1. 随机森林使用背景 1.1 随机森林定义 随机森林是一种比较新的机器学习模型。经典的机器学习模型是神...
【Dash系列】Python的Web可视化框架Dash(1)---简介【Dash系列】Python的Web可视化框架Dash(2)---安装【Dash系列】Python的We...
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
m6A相关的lncRNA怎么进行计算?下面我们就来探究下 1.表达矩阵下载[#%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E7%9F%A9%E9%98%B5%E4%B8%8B%E8...
http://www.bio-info-trainee.com/3409.html[http://www.bio-info-trainee.com/3409.html] 1、...
论文是Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication histor...
在硕士就读期间,就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少, windows 系统分析就足够了,作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。后来,随着高通量测序成本的降低...
@Ernie8 看过了,和你的基本一致,不过我不确定为什么会没有候选的基因
寻找R gene三种方法之RGAugury特别感谢卖萌哥[https://www.jianshu.com/u/77fc519c6fa2]对于R gene的资源分享和指导帮助 参考文献:RGAugury: a pipe...
你好,不知道能否请教你一些问题关于这个pl包的使用,我做的物种为小麦,使用该方法找到的R基因为0,我不确定是否是我安装有问题,能否请教下你
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基因组组装 基因组组装一般分为三个层次,contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
第1章 准备工作第2章 Python语法基础,IPython和Jupyter第3章 Python的数据结构、函数和文件第4章 NumPy基础:数组和矢量计算第5章 panda...