关注：六博说 第一时间获取更新
IP属地：安徽
-
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（四）：Merging objects
当合并多个单细胞染色质数据集时，我们必须注意到，如果每个数据集都是独立的进行peak calling，则它们得到的peaks可能不是完全一致的。Seurat在处理时会把所有不...
-
使用SnapATAC分析单细胞ATAC-seq数据（三）：Integrative Analysis of PBMC scATAC-seq and scRNA-seq简介 在本教程中，我们将对PBMC的两个scATAC-seq数据集(5K和10K)和一个scRNA-seq数据集进行整合分析。这三个数据集均来自10X genomics测序平...
-
“Simplicity is the ultimate sophistication.”
-
比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
-
MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
-
遗传学 博士
-
RIP-seq数据分析浅试（1）1.下载数据：ascp/prefetch。我们的服务器不要用ascp下，不要用ascp下，不要用ascp下！！！下不下来的。 命令：prefetch.2.9.3 -v SRR...
-
博主您好，请问一下MACS2和RIPseekerer获得峰的差异大吗？
还有第三部分“首先得到Uniq的reads”这一步什么意思？有些博主直接就去PGC重复了。RIP-seq数据分析浅试（1）
1.下载数据：ascp/prefetch。我们的服务器不要用ascp下，不要用ascp下，不要用ascp下！！！下不下来的。 命令：prefetch.2.9.3 -v SRR...
-
单细胞空间转录分析之Seurat-多样本整合（浅谈空间批次）单细胞空间转录组和单细胞分析类似，不可避免的会遇到多样本的问题，这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多张切片（slices）整合分析(Merge合并) 单细胞空间...
