在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习另一个很火的软件:STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
1.下载数据:ascp/prefetch。我们的服务器不要用ascp下,不要用ascp下,不要用ascp下!!!下不下来的。 命令:prefetch.2.9.3 -v SRR...
博主您好,请问一下MACS2和RIPseekerer获得峰的差异大吗?
还有第三部分“首先得到Uniq的reads”这一步什么意思?有些博主直接就去PGC重复了。
RIP-seq数据分析浅试(1)1.下载数据:ascp/prefetch。我们的服务器不要用ascp下,不要用ascp下,不要用ascp下!!!下不下来的。 命令:prefetch.2.9.3 -v SRR...
单细胞空间转录组和单细胞分析类似,不可避免的会遇到多样本的问题,这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多张切片(slices)整合分析(Merge合并) 单细胞空间...
0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控:fastp[https://git...