现在生信环境太乱。杂志社审稿人并非专业生信人,研究人员更多的还是想水文,加上一部分研究人员对代码只是复制粘贴,造成很多处理错误。审稿人懂还好,能把这种最低档水文拦住,关键审稿...

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The cancer genome atlas(TCGA)数据库储存20多种癌症的基因组数据,作为生信喵少不了要下载上面的数据来分析。写篇文章介绍一下,也加深自己的印象。 T...
写在前面:看官方文档,很可能会误认为很简单,或者有些人直接延用官方的路径。这都是不可取的,最重要的永远是自己的思路,不仅是科研方面的,还是代码绘图方面的。官方的绘图函数虽然比...
我用的是virtualbox+ubuntu记得修改内存、显存、存储、网络、共享文件夹安装好系统后记得安装增强功能,开无缝模式找到加载的磁盘,运行这个文件VBoxLinuxAd...
基本功能 geom_text_repel() geom_label_repel() 参数 example 1.给名称赋‘’(空值)来控制显示哪些labels2.显示所有lab...
1. Guided Clustering Tutorial Read10X读来自10X的数据,读出来是行为特征,列为细胞的矩阵CreateSeuratObject构建seur...
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这一篇只是fastp的官方manual,后面再放实操。 1. 主要功能 质量检测 排除质量较差的reads 剪掉质量低的碱基片段 reads首尾剪切 校正低质量碱基 poly...
很接近bowtie2与bwa 1. 基本流程 1.1. 建立参考基因组hisat2-build可为UCSC、NCBI、Ensembl等来源的fasta文件,多个文件以逗号分隔...