写在前面 前日，课题组每周小组会时排到我分享论文与研究进展。我大体看了下近期植物小RNA相关研究报道时，发现bioRxiv上，日本Takashi课题组上传了其所开展的柿子基因...
IP属地：北京
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柿子基因组测序与其性别决定系统的进化分析 -
Nature Plants｜多组学数据系统分析拟南芥茉莉酸信号通路Type: Article Title: Integrated multi-omics framework of the plant response tojasmonic ...
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hisat2+stringtie+deseq2 RNAseq（二）测序得到的是几百bp的短read， 相当于把拼图打散了给你。如果没有参考基因组，从头组装会有很大的工作量，而且对于有参考基因组的动植物来说，不依靠参考基因组进行RNAseq ...
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生信步骤|转录组测序上游分析：hisat2+samtools+stringtie
转录组分析在当下研究功能基因组领域十分常用。相关软件组合种类也十分丰富，本文采用了hisat2+samtools+stringtie策略从转录组数据中挖掘差异表达基因。在这里...
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超级爽！~精细比较近源物种 / 单倍型 / 基因组的神器！写在前面 三年前，那时往“全国植物基因组会议”投个了摘要，也准备了下墙报，有点期待能得到点认可。当然和以前一样，优秀跟我没啥关系。这是结果，结果当然不会反过来影响过程。为了让...
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WGCNA：选择某个模块绘制共表达网络前面的教程已经进行了WGCNA分析并将各个模块的网络图绘制文件导出，接下来将进行共表达网络的绘制，本次教程依旧根据PlantTech的Cytoscape课程[https://...
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R语言学习指南(5) ggplot2绘制终极版热图由于热图的需求实在是太过于旺盛，这一节我们继续来通过ggplot2绘制热图，各位看官老爷们，细细品味喜欢可以关注公众号R语言数据分析指南，先行拜谢了 scale函数对数据进行...
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快捷查找KEGG里的通路和基因
需求 1.快捷查找ID对应的description，知道通路对应的编号是多少。2.找出某一个/几个通路里的全部基因，用来做单独的下游分析。 如果是要做KEGG的富集分析，cl...
