最近打算把一部分的为知笔记中的笔记迁移到语雀中，迁移过程中发现为知笔记中非markdown的笔记另存的格式（htm,PDF等）都无法正常导入到语雀中，摸索了两种方法解决。 方...
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为知笔记迁移到语雀笔记 -
GFF3 转GTF文件在单细胞cellranger软件建库的时候必须要用GTF文件，但是有时候有些基因组只有GFF，这时候就需要转换一下格式。 1、GTF的格式类型 GTF3 (9 feature...
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需要你看下变量里面具体的名称，这里只是示例哈，
names(p@top_annotation@anno_list)
names(p@left_annotation@anno_list)Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置
ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
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看报错的提示，是不是因为你的数据是多层数据？可能需要检查下数据的结构，看下是不是要先合并下
seurat V5升级：一些常见报错
1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据，但是V3环境中导入V5环境会报错（缺依赖包）。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
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singularity环境变量
参考： https://docs.sylabs.io/guides/3.7/user-guide/environment_and_metadata.html[https://...
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SGE中qsub qstat的一些批量处理
这里我是使用的我另一篇文章中的function的方法，把代码加到环境变量中。 linux alias创建别名及创建带参数的别名（bash function[https://w...
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Pycharm的一些常用设置1、查看本地文件编辑历史（可回退） 首先点击需要查看的文件，然后在File / Local History / Show History进行查看，可以看到自己编辑的历史，还可...
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富集分析clusterProfiler包新加数据库（已有库安装）
富集分析的常用包clusterProfiler，一般都是安装人和小鼠的数据库来进行分析注释。这篇文章将介绍一下非人鼠的物种如何安装目前支持的数据库。OrgDb目前有20个物种...
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seurat v5整合步骤报错处理
参考：https://satijalab.org/seurat/articles/seurat5_integration[https://satijalab.org/seur...
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seurat V5升级：一些常见报错1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据，但是V3环境中导入V5环境会报错（缺依赖包）。目前有两种方式新建R对象数据CreateSeuratO...
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Seurat V5升级：sketch-based分析后DotPlot图报错解决最近在研究seurat v5的数据处理。测试的时候发现使用seurat v5包对大数据进行sketch-based抽样分析之后，后续使用DotPLit进行绘图的时候会报错： ...
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评论发不了，我私信你
My crochet designer软件绘制编织图解教程
当【野生】织女们突然有个不错的idea的时候，往往也想像编织书里面一样记录一下自己的编织图解，但是不知道怎么上手。我在网上也查了很多资料，介绍绘制编织图解的文章的确凤毛麟角。...
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My crochet designer软件绘制编织图解教程
当【野生】织女们突然有个不错的idea的时候，往往也想像编织书里面一样记录一下自己的编织图解，但是不知道怎么上手。我在网上也查了很多资料，介绍绘制编织图解的文章的确凤毛麟角。...
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空间信息在空间转录组中的运用桑基图在单细胞数据探索中的应用[https://www.jianshu.com/p/a7a6b8b11e3c]热图在单细胞数据分析中的应用[https://www.jians...
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嗯嗯，这里的width和height的设置其实可以看做是一个公式
Heatmap(mat, name = "mat",
width = ncol(mat)*unit(5, "mm"),
height = nrow(mat)*unit(5, "mm"))
参考截图中的设置，这里的5其实就是cellwidth和cellheight的大小，可以调整的Complexheatmap::pheatmap图cell尺寸设置
首先放出参考链接： https://jokergoo.github.io/2020/05/11/set-cell-width/height-in-the-heatmap/[h...
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shc加密shell脚本
1、下载安装 2、加入环境变量及测试 3、结果使用 运行完成后会在脚本同路径下生成一个*.x和*.x.c，分别表示加密后的可执行文件和可执行文件的原文件（C语言）我们使用*....