发简信
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singularity环境变量
参考： https://docs.sylabs.io/guides/3.7/user-guide/environment_and_metadat...
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R代码性能监控之前买的张丹的R极客理想的这本书想起来有R性能监控这部分的内容，学习了下。 1、Rprof 首先是R自带的Rprof包，不需要安装，直接导入即可...
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处理非可见字符参考： https://www.asciitable.com/[https://www.asciitable.com/] https://xda...
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SGE中qsub qstat的一些批量处理
这里我是使用的我另一篇文章中的function的方法，把代码加到环境变量中。 linux alias创建别名及创建带参数的别名（bash fun...
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Pycharm的一些常用设置1、查看本地文件编辑历史（可回退） 首先点击需要查看的文件，然后在File / Local History / Show History进行查看...
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富集分析clusterProfiler包新加数据库（已有库安装）
富集分析的常用包clusterProfiler，一般都是安装人和小鼠的数据库来进行分析注释。这篇文章将介绍一下非人鼠的物种如何安装目前支持的数据...
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seurat v5整合步骤报错处理
参考：https://satijalab.org/seurat/articles/seurat5_integration[https://sat...
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seurat V5升级：一些常见报错1、数据在不同环境中的兼容情况 目前V5版本的环境可以兼容V3版本的数据，但是V3环境中导入V5环境会报错（缺依赖包）。目前有两种方式新建R对象...
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Seurat V5升级：sketch-based分析后DotPlot图报错解决最近在研究seurat v5的数据处理。测试的时候发现使用seurat v5包对大数据进行sketch-based抽样分析之后，后续使用DotP...