我把这个思路搬运到我的课题里,复现图如下: 相似度:75%。a和b是用AI画的,所以今天分享下c和d的代码 一 差异分析 假设我们有了这样的一个表达矩阵,叫Expr_all。...
nmf运行太慢咋整
实战-TCGA数据的NMF聚类和可视化0.NMF NMF是非负矩阵分解,也是常用的划分亚组(亚型)的聚类方法之一咯。 代码主要参考了帮助文档和曾老板的博客:http://www.bio-info-trainee....
MOVICS包整合多组学数据进行分析,其安装的过程太让人心酸,大家安装的过程慢慢体会,下面就来学习下这个由“大鱼海棠”老师开发的R包吧。 1.示例数据 brca.tcga.R...
需完成作业 原始数据 完成情况 仍需改进,欢迎提供更改意见 参考代码 [如何一键绘制具有显著性检验信息的箱线图/小提琴图?](如何一键绘制具有显著性检验信息的箱线图/小提琴图...
《R for Data Science》第二、三章 Data visualisation 啃书知识点积累 参考书籍《R for data science》《R数据科学》The...
R 基本概念 ggridges 数据形态 散点图+密度分布图/柱状图
数据下载 官网访问有障碍,直接去xena吧。 1.读取表达矩阵 2. 读取注释信息 3.表达矩阵和临床信息对应起来 4. 单基因表达量画图 5.两个基因的相关性图 6.炫酷的...
0.NMF NMF是非负矩阵分解,也是常用的划分亚组(亚型)的聚类方法之一咯。 代码主要参考了帮助文档和曾老板的博客:http://www.bio-info-trainee....
这也太少内存了,是不是得加内存条,购买服务器了
需求:下载DNA损伤修复相关的基因列表。 第一步 搜索数据库 进入GO (Gene Ontology) 数据库网页 http://geneontology.org/ ,在搜索...
可变剪接内容学习 概念 可变剪接(Alternative Splicing,AS)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异...