生物信息学
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如何给热图heatmap添加指定的标签？当我们画热图（heatmap）的时候，如果基因的名字比较多的时候，在热图中展示的话，就会出现名字重叠的情况，针对这个情况，我们有两种比较好的解决办法，第一是在热图中仅显示关注...
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DAVID富集分析及R语言可视化DAVID富集分析 DAVID富集支持多种基因名类型，本次以genesymbol为例 DAVID：https://david.ncifcrf.gov/ 进入之后跟着以下步骤操...
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R语言-均值填充缺失值
在基因芯片数据或其他类型数据中，采用计算所有样本的平均值从而进行填充，如果需要用中位数或其他统计量填充时只需修改相应的方法即可 #1. 检查是否有缺失值 which(is.n...
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GSEA的分析汇总-转载
GSEA的分析汇总 学习GSEA 生信技能树 GSEA的统计学原理试讲 GSEA GSEA这个java软件使用非常方便，只需要根据要求做好GCT/CLS格式的input文件就...
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R语言绘图包07--多集合可视化UpSetRR语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
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R语言-limma差异分析与heatmap绘制#mRNA表达矩阵与GROUP文件样式，heatmap样式见文章最后 library(limma) mRNA <- read.table("表达矩阵.txt",sep = "...
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R语言-均值合并多个探针对应一个基因
数据框：mRNA； 基因名列：Symbol（在该数据框最后一列）； results = t(sapply(split(mRNA,mRNA$Symbol),function(x...
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单细胞RunPCA()结果解读+DimHeatmap的用法单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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《机器学习与R语言实战》笔记汇总简介 这本书是一位韩国的数据科学家写的书，书并不新，几年前的，虚拟机都已经过时，但全书读下来最大的感受是内容写的很详细，可以照着步骤实践，加深了对机器学习的理解，或者说是一本...
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Stay Hungry. Stay Foolish<br>学点R语言，搞点数据挖掘<br>专注肿瘤研究和学习<br>ORCID:<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Forcid.org%2F0000-0002-0660-7802" target="_blank">https://orcid.org/0000-0002-0660-7802</a><br>CSDN：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Flijianpeng0302%3Ftype%3Dblog" target="_blank">https://blog.csdn.net/lijianpeng0302?type=blog</a> 生信小鹏
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