多组学流程开发
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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要有自己的笔记，不能就这样把PPT放上来
四、Linux之shell脚本编程
1.Linux系统环境 2.变量 3.结构化语句 (1)if语句 (2)while语句 参数扩展3.2.9 4.Shell脚本编程 任务提交
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这是旧版本的了，新版本conda安装后不再这这样
linux安装或卸载miniconda
Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。 1.安装conda 浏览器搜索 miniconda 清华 ...
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对bed文件有些疑问，对于外显子测序，真的使用这个文件吗
8 比对及找变异步骤的质控
使用qualimap对wes的比对bam人家总结测序深度和覆盖度 1 比对的各个阶段的bam进行质控 可以把中间生成的.bam文件删除，就是带marked的bam文件 安装b...
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@NICE_AGIS 如果你测试OK，那就用自己的方法
samtools的安装和使用
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。能够实现二进...
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直接删除这一行就好
关于外显子坐标文件的一个问题
今天在跑gatk call variant的时候，报了这样的一个错误 报错信息说：坐标文件中有一个位置的终止坐标69716217，而起始坐标是69716218，也就是说终止坐...
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要不要出个工具合集。。。虽然网站也能用，但是学了生信就只想用R或Linux了
SNP功能注释网站合集
这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后，优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后，请坚持看完 1、GWAS4D, 推荐指数：**** 网址：htt...
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关于mac电脑连接服务器掉线的解决方法
是在mac的家目录里面.ssh添加多一个config 然后写入这下面几行行 然后回车，新起一行，按一下 Ctrl C 结束，最后重新登录服务器即可
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非常感谢你的反馈，我会仔细检查一遍，更新后再发布
用picard制作外显子坐标文件
--------------- Nickier 2018-12-07 --------------- 第一次用picard，不知道怎么用，先用conda安装了一个 找到需要的...
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linuc系统与工具
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上游分析结合数据好好理解一下，每一步都做了什么，数据背后的生物学意义又是什么
RNA-seq实战分析流程
一、下载测序数据 ①SRA数据库[存储二代测序的原始数据]②在进行上游分析时，数据格式转换过程概述如下：sra↓FASTQ↓bam↓counts③质控处理的相关软件：• fa...
