T 细胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效应T细胞）： 辅助...
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【单细胞转录组】人类T细胞亚群分析Marker基因汇总 -
免疫学笔记-1 | T细胞分化发育及其Marker1 关键细胞类型或Marker缩写： 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...
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服务器管理之Linux如何查看哪个进程占用的SWAP分区比较多在日常管理中，我们经常会遇到swap[https://so.csdn.net/so/search?q=swap&spm=1001.2101.3001.7020]分区使用比较多...
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小鼠基因富集分析之任何通路
今天忙里偷闲，自创了一套基于小鼠基因list的富集分析方法，主要原理是将之前用于人的基因富集分析方法搬运到小鼠上，大家可以各抒己见，在下方留言。 那么，开始展示 故事要从一个...
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STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观，所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析，挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合，或者显著差异表达的基因集合等等。...
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cellchat版本更新了，请查看最新版本的tutorial，https://htmlpreview.github.io/?https://github.com/sqjin/CellChat/blob/master/tutorial/CellChat-vignette.html
单细胞分析之细胞通讯：cellchat
这篇文章在2020年7月上传到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...
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关于以chatGPT为代表的人工智能的一些思考
最近这个chatGPT非常火爆，能聊天，有问必答，还能写论文写诗歌写代码，那我们人类离取代还有多久？这东西会不会有自我意识？机器能不能有自我意识？让我想到人工智能有一个著名的...
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@e0bcf884eb4f hhh，谢谢
谷歌云盘文件无法直接下载怎么办？
今天在准备复现一篇Cell的文章时遇到一个问题，就是那篇文章的原始分析数据共享在谷歌云盘上了，即便家里的网速不慢，另外加之用上IDM下载器，但依旧无法直接下载。既然有这样的需...
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生信技能树新叶讲师<br>这里是新叶的分身马甲：信你个鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>欢迎学习交流
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不管何时，也要努力的学习吖，加油！！！
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将单细胞的表达矩阵输出为matrix.mtx.gz
前言，今天在群里看到有人提出说遇到一个稀疏矩阵转普通矩阵的报错问题，感觉这个问题自己以后可能也有遇到，所以做了这个报错的可能解决办法的记录。 这里举出两种语言去将单细胞的表达...
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服务器de novo部署shiny app到网页上为了方便别人快速使用我们文章的数据，先前给自己的project开发了一个shiny app，现在需要把这个APP部署到网页上，因此记录下整个部署过程。使用的是个空白的服务器，...
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【zombie】如何查看并杀死僵尸进程?僵尸进程定义 In UNIX System terminology, a process that has terminated,but whose parent has n...
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R语言绘图之图片的局部放大（基础知识）下面这张图大家应该常见吧 一张图的局部放大，我们来实现一下， 示例数据 开始画图,先画散点图 好，开始局部放大 最后我们修改主题和风格 当然，可以进一步优化，比如把细胞注释的...
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[R语言] 单因素方差分析和多重比较示例数据集如下： 导入数据作简单可视化 正态性检验 当分析小于50行的小样本数据时，用Shapiro-Wilk 检验 当分析大于50行的大样本数据时，用Kolmogorov-...
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conda操作-3 | Jupyter notebook安装及其虚拟环境设置1. 在base环境中安装jupyter notebook 2. 在base环境中安装ipykernel 3. 在目标环境中安装ipykernel 4. 在base环境中将目...
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monocle3 在linux 终端R可用，但在Rstudio server无法使用
问题，报错其实很直接，就是有个动态库找不到 解决尝试一，重装terra，但是依旧报错，说明此方法不行 进一步查看原因，会发现其实就是 libgdal.so.20 => not...
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R语言中多线程运行程序
R 代码的运行效率不高，因此有时候可以考虑并行运行程序。 #apply系列函数 实际不是并行 ##lapply() 接受一个向量或者列表作为处理对象，返回结果是是与输入等长的...
