比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
发简信
IP属地：广东
-
RNA-seq(5):序列比对：Hisat2 -
比对软件（DNA or RNA序列）的区别
文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 更多说明：https://zhuanlan.zhihu.com/p/451939113[https://zhuanla...
-
R绘图：ggplot2绘制火山图火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
-
bedtools intersect用法 (intersectBed)bedtools intersect可以对两个基因组特征 (genomic features) 进行overlap，找到两者重合的区域。比如求两个peaks的交集，或者看很多...
-
利用HOMER预测目标序列的motif（从运行程序到结果解读，以及注意事项）关于查找motif，目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO（MEME套件里的一个），但是有很多文献里也提到了HOMER这个软件，并且不乏一些影响因子很高...
-
R语言基础--包的操作与内置数据集R语言包的安装 参考文章 在R中大概有几种包的安装方式。 install.packages()常规包的安装 括号里面包的名称要加英文引号，在列出的CRAN镜像站点列表中选择一...
-
ggplot2的x轴坐标顺序不对肿么办起因 这是一个天朗气清的日子。我正无聊的翻看着聊天记录，突然一道题出现在我的视野里： 图是这样的： 思路 1.这图应该是ggplot2，theme_bw主题的箱线图（geom...
-
conda 安装R语言及其R包
00 缘起 最新的R 3.5 版本特别难安装，而且很多新的包只能在R3.5版本上工作。之前用 make source 的方式总是出错，R3.5的更新依赖太多，需要安装很多依赖...
-
RunPCA时遇到error in irlba(A = t(x = object), nv = npcs, ...) : max(nu, nv) must be strictly les...
> pbmc <- RunPCA(pbmc, features = VariableFeatures(object = pbmc))Error in irlba(A = t(...
