刘小泽

刘小泽写于2020.5.29这篇文章做了一件事，就是帮助我们区分不同的批次矫正方法，然后比较了一下优劣 文章题目：Flexible comparison of batch c...

天涯清水

批次效应除去-GEO案例分析 最近分析来自不同平台的GEO数据，GEO分析推荐学习Jimmy大神的B站视频，也可以学习我之前的教程。limma和sva两种方法进行批次效应去除...

天涯清水

多种批次效应去除的方法比较 原创 生信技能树 前面我在生信技能树推文：你确定你的差异基因找对了吗？ 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分，而...

果蝇饲养员的生信笔记

一、什么是批次效应 批次效应（batch effect），表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何生物变异无关的技术差异。批次效应是高通量试验中常见的变异来源...

生信师姐

经常有小伙伴问如何绘制下图这样代谢通路与热图的组合图，其中的代谢通路一般都需要经过“简化合并”，而热图一般使用通路中部分关键基因的表达量差异倍数（Log2FC）进行绘制，这样...

PriscillaBai

前言：未成熟T细胞处于静止状态，这时细胞尺寸很小，到G0期时变成活跃状态。当抗原刺激后，T细胞受体TCR便引发了一系列的下游反应，包括招募白细胞介素2和细胞表面受体，启动细胞...

可能性之兽

Notch信号传导通路是决定细胞命运的最重要的通路之一。Notch通路比较复杂，主要由四部分组成：Notch受体、Notch配体、CSLDNA结合蛋白、下游靶基因。其中任何一...