生信石头

写在前面 前日，课题组每周小组会时排到我分享论文与研究进展。我大体看了下近期植物小RNA相关研究报道时，发现bioRxiv上，日本Takashi课题组上传了其所开展的柿子基因...

生信石头

写在前面 节前，我临时收到钦佩已久的胡老师的微信语音，主要问及“EasyCodeML”这款软件能有批量运行。有关注Raindy（福建农林高芳銮老师）和生信札记的朋友应该知道。...

组学大讲堂

所周知，基因家族分析是一个研究思路，同时也可以自成一篇文章。不过大部分基因家族套路式文章影响因子在2-4分，但最近一篇小麦MADS-box家族文章却发表在New Phytol...

小郑的学习笔记

我在搜寻基因家族的一些资料，发现两个数据库挺有用的，可以查询基因家族的相关信息 一个是拟南芥的数据库，里面包含拟南芥的所有基因家族信息 https://www.arabido...

丫丫小玩子

文章信息 题目：Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros f...

多啦A梦的时光机_648d

如上图需要准备三个文件。 1.一个###必须的###基因对信息文件，大体格式如下（tab分割）： 2. 一个##必须的##cds序列文件（其中必须包括要用到的基因对对应的CD...

多啦A梦的时光机_648d

一：模型预测 1. swissmodel预测（网址https://swissmodel.expasy.org/） 原理：相似的氨基酸序列对应着相似的蛋白质结构要求：找到与目标...

组学大讲堂

由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.aln文件，可读性差，无法满足高质量期刊的要求。因此，在实际操作过程中，需要对一些多重序列比对的文件进...