分析连续变量之间线性相关程度的强弱，并用适当的统计指标表示出来的过程称为相关分析。本文主要介绍比较常用的 Pearson相关系数、Spearman秩相关系数。这两个相关性系数...
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相关性分析 Pearson 相关系数 和 Spearman 秩相关系数
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测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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ctDNA、cfDNA和CTCs的区别(1)CTCs 就是循环肿瘤细胞(circulating tumor cells)的简称，这玩意就是从原发肿瘤甚至是转移形成的新肿瘤上掉落下来，并且进入到患者的外周血循环系统...
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最全Bedtools使用说明--只看本文就够了1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集，它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
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ATAC-seq分析实操生信技能树健明教程放在最前面的参考链接：给学徒的ATAC-seq数据实战（附上收费视频) 数据来源的文章： The landscape of accessible chromatin in m...
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2020-04-13 WGBS测序质控及分析记录
测序数据质控fastp genome preparation alignment bismark_deduplication picard_deduplication ext...
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生信分析学习笔记 - RNAseq （六）FeatureCounts声明：本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记，不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理，序列回帖到数据可视化...
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seurat结果转为scanpy可处理对象
作者：ahworld链接：seurat结果转为scanpy可处理对象来源：微信公众号seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 怎样把seurat的对象转换...
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【基因组学】提取基因的启动子序列
写在前面 通常我们碰到的是，根据gff文件提取cDNA序列，这个比较容易满足，但是有时候我们需要构建native promoter 载体的时候，就需要提取cDNA前面的序列，...
