会嚼薯片再做科研

1. R包的调用及工作路径设置 2. 数据导入及数据清洗 3. 统计不同变化的频数并挑选拟标注的显著基因 4. 绘制火山图

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最近有朋友问R中绘制冲积图的代码，其本质仍然是条形图只是添加了样本间的连线；案例要求按列计算每个样本的相对丰度跟往常有所不同。下面小编就来简单介绍一下代码 加载R包 导入数据...

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对基因启动子元件分析，可以用plantCARE进行分析，结果文件直接发送邮件：plantCARE链接：http://bioinformatics.psb.ugent.be/w...

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1. 亚细胞定位 细胞内含有多种细胞器，如细胞核、线粒体、高尔基体、内质网、叶绿体、细胞膜、细胞质等，这些都可以被称为“亚细胞”。蛋白通常分布在细胞内不同位置，实现机体不同功...

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Introduction 上次简要介绍过了微生物组中生物合成基因簇（BGCs）分析[https://mp.weixin.qq.com/s/4eH0zSR9B-iBZRUUs8...

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单个热图 单个热图是最常用的数据可视化方法。虽然ComplexHeatmap包的“亮点”在于它可以同时高效可视化一个热图列表，作为热图列表的基本单元，配置好单个热图是很重要的...

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与其他软件包集成 9.1 pheatmap热图 pheatmap用于制作热图是一个很不错的 R 包，启发了许多其他热图包，例如ComplexHeatmap。从ComplexH...

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注：一致性聚类通常被用于确定最佳的聚类数目K 聚类分析传统方法的不足不能提供“客观的”分类数目的标准和分类边界,例如Hierarchical Clustering。需要预先给...

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🎣®[转载][R]从Github上轻松安装R包①—githubinstall包🎣®[R]从Github上轻松安装R包②补充🎣®[R]从Github上轻松安装R包③无法下载Gi...

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ComplexHeatmap学习笔记①Introduction to ComplexHeatmap package Making A Single Heatmap 单热图(A...

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数据及基础图形的绘制 1、数据——以R自带数据集iris为例 2、基于ggplot2包绘制散点图 局部放大效果的实现 1、加载包——主要基于ggforce包实现图形的局部放大...

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跟着 Nature Communication 学作图 | 百分比堆积柱状图+卡方检验 今天我们复现一幅2021年6月发表在nature communications上的热图...

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OmicsSuite v1.3.9OmicsSuite: 定制的流程化多组学大数据分析及可视化的桌面端套件。Note:OmicsSuite前名为BioSciToolsGith...

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在集合数少的时候韦恩图是很好用的，但是当集合数多比如 5 个以上的时候那就会看的眼花缭乱了。推荐用UpsetR进行集合的绘图。 1. R包的安装及示例文件的加载 这个R包里的...

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前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发，ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制，如多数据热...