jjjscuedu

Whittaker（1972）提出了以下三种多样性。 Alpha多样性（α多样性），指某个群落或生境内部的种的多样性。这个指标是指一个群落内物种的个数(species ric...

Karupin99

今天在一个群里有人问这张图，大神回答说是双向柱状图(正负条形图)，感觉挺有意思的，于是顺手搜一下教程学习一下。 首先读取下要用到的数据 （我在NC的一篇文章中下载的，并根据本...

ZMQ要加油呀

6.1 Vdr−/−小鼠数据集 小鼠肠道微生物组数据(金等人)。(2015年)是从维生素D受体基因敲除(维生素D受体−/−)和野生型(WT)小鼠的粪便和盲肠粪便中产生的，具有...

R语言_茶味先生

1. 相关性检验 得出相关系数我们并不一定能得出数据之间的相关水平，这时候我们会进行相关性检验来进行量化。置信区间:confidence interval，是指由由样本统计量...

小明的数据分析笔记本

最近好几位读者在公众号后台留言PCoA。今天的推文就来简要的介绍一下PCoA在R语言里实现的代码。具体的原理我自己也没有看明白。目前的理解是：这个PCoA(主坐标分析)和主成...

Seurat_Satija

美图神器ggstatsplot-专为学术论文而生 在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多个R包了简单讲ggstatsp...

DumplingLucky

1.数据标准化 为了统一数据的量纲并对数据进行中心化，在主成分分析之前往往需要对原始数据进行标准化。下面以R语言自带的iris范例数据集为例，探索一下主成分分析的具体过程。 ...