代码确实有问题欸,每个基因都只出现一次突变
TCGA突变数据挖掘:把样本整理为突变型或野生型一从TCGA下载突变信息 这里下载的是maf文件 二把样本根据是否突变分为野生型和突变型 可以看到包含了突变基因和对应的样本 最后 感谢jimmy的生信技能树团队! 感谢导师...
代码确实有问题欸,每个基因都只出现一次突变
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后面的代码是有问题的,筛选出来的每个基因只在一个样本里有突变。这不对
一、准备工作-目录管理 一句命令同时创建多个同级别文件夹,规律存放,方便溯源几个文件的作用分别为“软件安装,数据库存放,流程搭建目录,项目分析,数据备份” 二、数据下载 流程...
@e0cb837cd5b9 我终于知道了!!!需要把raw文件夹删除!因为默认是有raw数据的
scCancer包:自动分析肿瘤单细胞转录组利器scCancer包是2020年 清华大学Jin Gu团队开发的一个专门用于分析肿瘤单细胞转录组的工具包。它集成了单细胞数据分析的基本流程(Seurat),增添若干适合肿瘤数据...
@sugarballer 你好,请问你现在找到解决的办法了吗?我试了很多方法还是同样报错😭
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@黄宗伟_0c76 你好,目前我也还没有打通这部分内容😭还在尝试
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你的barcode文件里面是不是包含多个样本的信息?会不会是这个原因引起的(一个文件只能一个样本)? @黄宗伟_0c76
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@小贝学生信 就是我只有filtered的三个文件,没有raw文件;但是跑代码还是会报错提示barcode文件缺失(实际上filtered文件夹里是有的),纠结在这个问题嗷
这几天我似乎想明白了一些,会不会是因为这个barcode里面有两种样本呀?那我拆分一下,等我有空先试试哈
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您好!看了您的代码解析受益匪浅!我能咨询您一个问题吗?我只有filtered_feature_bc_matrix(~1w cells)数据,跑代码会出现报错:Barcode file mising.不知如何解决?您能帮忙看看吗?感激不尽!🙏
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