使用susieR鉴定多个因果变异位点只需要两个输入文件,一个输入文件是包含Zscore值的SNP位点(zscore.txt),另一个文件是LD matrix(LD.matri...
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之前教程提到过Metal是可以做Meta分析,除了Metal,PLINK也可以进行Meta分析。命令如下所示: 输入文件gwas1.plink文件如下所示: 输出结果如下所示...
基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是两个不同的概念。一般而言,通过PLINK、GCTA等工具计算...
GWAS表型的标准化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization、Z-score normalization等...
GWAS:mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。以抑郁症状...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通过对多个表型相似的GWAS summary结果进行联合分析,发现更多的表型相关基因座。以抑郁症状...
1、scDRS的计算原理如下所示: 图片来源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distingui...
LDSC 除了可以计算基因多效性、遗传度、遗传相关性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=224748...
本周最新文献速递20220522 一、精细解读文献 一 文献题目: Single-nucleus chromatin accessibility profiling high...
本周最新文献速递20220515 一、精细解读文献 一 文献题目: Multi-ancestry genetic study of type 2 diabetes highl...
本周最新文献速递20220508 一、精细解读文献 一 文献题目: Plasma proteome analyses in individuals of European a...
本周最新文献速递20220423 一、精细解读文献 一 文献题目: Nonlinear control of transcription through enhancer–p...
图片一直上传失败,需要看的亲们请移步我的博客,同名:橙子牛奶糖
本周最新文献速递20220410本周最新文献速递20220410 一、精细解读文献 一 文献题目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文献速递20220410 一、精细解读文献 一 文献题目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文献速递20220327 一、精细解读文献 一 文献题目: Genetic regulation of post-translational modification...
本周最新文献速递20220313 一、精细解读文献 一 文献题目: Prediction of histone post-translational modification...
本周最新文献速递20220306 一、精细解读文献 一 文献题目: Genome-wide analysis provides genetic evidence that A...
本周最新文献速递20220227 一、精细解读文献 一 文献题目: Genetic associations of protein-coding variants in hu...
本周最新文献速递20220123 一、精细解读文献 一 文献题目: Multi-ancestry eQTL meta-analysis of human brain iden...