Bugs Solution设置 type = 'binary'
发简信
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配置gcc环境以完成R包安装
然后配置/home/.R/Makevars文件 也可以手动安装更新gcc的版本，需要注意先安装依赖并注意版本不能过低。 对于系统中安装了多个gcc版本的可以通过修改Makev...
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hdf5r installation related problems in rstudioserver在服务器中安装了各个版本的hdf5，目前大部分的R包都需要hdf5>1.8。所以在对于需要依赖服务器文件的R包安装时的关键步骤有两点: 在服务器上所依赖的包版本是否合适(大部...
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运行STAR时遇到的错误
在开始对比时，使用如下参数 出现如下错误BAMoutput.cpp:27:BAMoutput: exiting because of OUTPUT FILE error: c...
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生信笔记5-GWAS与eQTL引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析（Genome Wide Association ...
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Error in irlba(A = t(x = object), nv = npcs, ...): BLAS/LAPACK routine 'DLASCL' gave error code -4跑了几百遍seurat的单细胞流程了，今天竟然遇到RunPCA()时候报错。先用google后用 百度，最后换必应终于搜索到irlba github上 issue part ...
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no-root solution with '/lib64/libm.so.6: version `GLIBC_2.23' not found'
Question安装scPhere需要Tensorflow-1.14.0.全部安装完成后运行example/script/demo.py 报错： SolutionW1. 创建...
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scMLnet 包：使用单细胞测序数据推断细胞通讯中的“配体-受体-TF-mRNA”调控网络（单细胞多层网络）生信碱移 scMLnet 使用笔记 本文将介绍如何使用 scMLnet 从单细胞 RNA 测序数据推断细胞通讯中的调控网络 中山大学 孙小强 教授团队于2020年开发了一种 ...
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ggpubr实现每个group和总体均值的单边t-test + 设置画布默认参数设置画布默认参数 单边t-test 主要的参数设置是ref.group ='.all.'ref.group: 添加一个control group进行检验 result 结果很...
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How to source R code from another Jupyter notebook file
Question:用Jupyter nokebook来写R， 想实现source功能。 source() 函数只能识别file.R，%run 只能用于python脚本的模块导...
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「R shiny 基础」初识Shiny传送门 Shiny基础教程: 「R shiny 基础」初识Shiny 「R shiny 基础」如何进行网页布局 「R shiny基础」增加一些小控件 「R shiny基础」交...
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Linux服务器安装jupyter，并配置python和R环境今天上午看了好几个教程，踩了好几个坑，把服务器配置上了jupyter，安上了之后一试用，觉得哇，又好看又方便，一瞬间就入坑了。 之前因为自己的电脑实在带不动上万个单细胞的数据...
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使用PHATE可视化单细胞数据在单细胞标准分析中，在两个地方使用了降维技术，特征提取和可视化。特征提取我们都知道用的是PCA，在数据分析领域是比较常见的一种主成分提取的方法，可视化为什么也算是一种降维技术...
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单细胞数据科学中的里程碑与检查点我们曾经在一节公开课里面提到过单细胞数据科学的几个主特点： 继承了很多Bulk的分析方法 商业开源，容易上手 开发速度快 教程文档丰富 数据分析过程非线性 基于以上特点，我们...
