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发简信
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运行STAR时遇到的错误
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生信笔记5-GWAS与eQTL引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析（Genome Wide Association ...
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scMLnet 包：使用单细胞测序数据推断细胞通讯中的“配体-受体-TF-mRNA”调控网络（单细胞多层网络）生信碱移 scMLnet 使用笔记 本文将介绍如何使用 scMLnet 从单细胞 RNA 测序数据推断细胞通讯中的调控网络 中山大学 孙小强 教授团队于2020年开发了一种 ...
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「R shiny 基础」初识Shiny传送门 Shiny基础教程: 「R shiny 基础」初识Shiny 「R shiny 基础」如何进行网页布局 「R shiny基础」增加一些小控件 「R shiny基础」交...
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Linux服务器安装jupyter，并配置python和R环境今天上午看了好几个教程，踩了好几个坑，把服务器配置上了jupyter，安上了之后一试用，觉得哇，又好看又方便，一瞬间就入坑了。 之前因为自己的电脑实在带不动上万个单细胞的数据...
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使用PHATE可视化单细胞数据在单细胞标准分析中，在两个地方使用了降维技术，特征提取和可视化。特征提取我们都知道用的是PCA，在数据分析领域是比较常见的一种主成分提取的方法，可视化为什么也算是一种降维技术...
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单细胞数据科学中的里程碑与检查点我们曾经在一节公开课里面提到过单细胞数据科学的几个主特点： 继承了很多Bulk的分析方法 商业开源，容易上手 开发速度快 教程文档丰富 数据分析过程非线性 基于以上特点，我们...
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桑基图在单细胞数据探索中的应用什么是桑基图 桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，比较适用于用户流...
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