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  • 关于连锁不平衡

    连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一个群体中,不同座位上两个基因同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象。我们一般用D,D'和r2来表示...

  • 基于R查找SNP的相关信息(包括所属基因和研究进展)

    一定要夸夸R,可真是太棒棒啦!以下操作均基于R. 首先安装biomaRt:BiocManager::install('biomaRt') 加载:library(biomaRt...

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    SNP功能注释网站合集

    这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后,优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后,请坚持看完 1、GWAS4D, 推荐指数:**** 网址:htt...

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    GWAS分析-说人话(15)- 如何查看SNP所在的基因

    前言 当我们获得一堆“感兴趣”/“有意义”的SNPs之后, 怎样知道这些SNPs所在的基因呢? 不要告诉我一个一个在pubmed查就好~ 我们需要知道Plink哪个参数可以帮...