最近一周开始学习ATAC数据分析,目前只是尝试了简单分析,新手小白,如果有小失误欢迎留言~ 1.准备环境 创建conda环境(如果已有成熟环境不需再次创建) 激活环境 2.安...
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1. 整合不同数据集中同一类细胞方法: 该方法来自一篇21年5月份的Nature:Cross-tissue organization of the fibroblast li...
数据全部来自微信公众号:生信小知识,感谢生信小知识提供的学习平台 准备数据test.csv 安装R包 载入环境 准备测试数据 数据格式调整 NOTE:表中数据整合为种结构化的...
数据是自己随便编的,需要准备一个txt文件BMI.txt 简单柱状图绘制 参数调整 如何美化 如何画一张好看的箱线图: 由于数据是自己编的,画出来的图数据显示的不是很好。
本篇数据完全来源公众号“老俊俊的生信笔记” 数据来自参考文档:https://github.com/junjunlab/tackPlotR/wiki[https://gith...
此次学习的m6A/MeRIP-seq 适合单个细胞样本或者bulk样本 work flow 需要用到的包: Cutadapt, tested with 1.15Samtool...
准备数据文件.txt 这里准备的是BMI.txt(依旧是自己准备的数据) 绘制小提琴图: 小提琴图添加箱线图: 由于没有合适的数据,会出来的图有些许怪,主要关注绘图的方法~
马上放假了,今天我们来点基础的东西,画图的操作。 不想要这么丑的图。图片 要优雅的输出结果 图片 「ggplot2中柱状图基本绘制函数常用geom_bar()」 参数介绍: ...
单细胞分析流程之Cell Ranger结果解读 各位小伙伴大家好! 上期我们说到了Cell Ranger的下载、安装以及常规的使用方法,这期我们就来了解读一下这些结果吧~ 0...