scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]，...
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使用scVelo进行RNA velocity分析-01 -
RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理目前有多种方法可以进行RNA velocity的分析： scVelo（参考文章：单细胞转录组数据分析|| scVelo 教程：RNA速率分析工具） velocyto （官网:...
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暂别简书，后会有期
我不是老师，也不是大神，更不是前辈。我只是个普通的科研工作者，一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了，期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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单细胞之轨迹分析-1：RNA velocityRNA velocity原理此前已经介绍过，参考单细胞测序的轨迹推断[https://www.jianshu.com/p/83c532234dc0]。 1. loom文件准备...
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单细胞分辨率下肾细胞癌和微环境的多区域表征[10X单细胞联合10XVDJ分析、Mutation Calling]hello，大家好，我们的分析也慢慢进入深水区了，很多方法需要联合起来使用，如何灵活运用各种方法，就需要我们的经验和智慧了。今天分享的文献在Multi-regional ch...
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使用xcell根据表达谱推断样本组成细胞的类型一般的组织样本或者血液样本并非单一细胞构成，其都存在异质性，这种非单一成分样本的测序属于bulk RNA-seq，测序的结果表示的也是组织整体上的动态平均水平。而在肿瘤异质性...
