去重 按symbol列去重,常见标准有3个:最大值/平均值/随机去重 方法1.随机去重 方法2.求平均值
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去重 按symbol列去重,常见标准有3个:最大值/平均值/随机去重 方法1.随机去重 方法2.求平均值
写在前面的话:GSEA对于生物信息学技能的要求不高,以至于不需要太多的生信知识就能学会,这也成为了生物研究生的必备技能,如果你还不会的话,这篇教程将让你100%学会,只要你从...
01TeX的介绍与认识 目录 本系列是有关LaTeX的学习系列,共计19篇,本章节是第1篇。前一篇:无后一篇:02LaTeX学习系列之---TeX环境的搭建总目录:19LaT...
1. 一代测序(Sanger sequencing) 双脱氧链终止法采用DNA复制原理。 Sanger测序反应体系中包括目标DNA片段、脱氧三磷酸核苷酸(dNTP)、双脱氧三...
相分离或者说相变(Phase separation,Phase Transition)是目前比较火的一个研究领域,已有的研究表明相分离在细胞中普遍存在,与基因组的组装、转录调...
2011年,美国Pacific Biosciences 公司正式发售第三代测序系统—PacBio RS。这是一台革命性的DNA测序系统,它融合了新颖的单分子测序技术和高级的分...
FPKM 一般来说不太好用,转为TPM进行后续的分析比较合适。下面是FPKM转化为TPM的R实现: 参考: RNA-Seq的Counts和FPKM数据如何转换成TPM?[ht...
在高通量测序当中,很重要的一块就是检测基因的表达量,它是差异分析和转录组数据分析的基础。与q-PCR相似,基因表达量的衡量也是采取相对定量的方法。落在一个基因区域内的read...
什么是测序深度和测序覆盖度 测序深度(depth)是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值,可以理解为基因组中每个碱基被测序到的平均次数。测序深度 = reads长度 ×...