IP属地：青海
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱...
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10.GWAS：LD decay(LD衰减）—— PopLDdecay关于连锁不平衡的详细介绍在之前的帖子里有说过，这里就不再赘述，本篇主要介绍LD decay的计算。1.GWAS：原理与目的 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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admixture 群体结构分析
群体遗传学中测的很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看那几个物种聚在一起，一般使用的软件就是STRUCTURE， 但是STREUTURE运行速度极慢...
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研究方向：基因组学、转录组学、遗传学<br>边做边分享，超不定期更新
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GWAS全基因组关联分析：TASSEL 5.0 Windows版软件使用教程TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
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9.2 GWAS：关联分析——TASSEL（GLM/MLM/CMLM)
TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件，还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估，功能非常强大，要说缺点，可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍，这...
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中国科学院遗传发育所 生物信息学博士<br>专注于基因组组装和群体重测序研究
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GWAS全基因组关联分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出来...
