在对拼装或者数据库下载的序列文件进行下一步分析时，我们通常会对序列进行去冗余操作，其中经常需要提取同一个‘gene’的最长转录本，所以动手用python写一个脚本。 一、基本...
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用Python提取FASTA中最长转录本 -
基因家族分析（2）：基因家族鉴定与蛋白质性质简单分析本文主要工作内容：（1）使用HMM和NCBI-CDD对基因家族进行鉴定（2）使用几个网站对基因家族表达蛋白质的简单性质进行分析 2.基因家族鉴定与基本特征探究 2.1 基因家...
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GeneDoc | 多序列比对总结
1️⃣ 比对软件对fasta 序列进行比对🍒比对方法可以有MEGA(ClustalW，Muscle), ClustalX以及MAFFT等软件。还可以用GeneDoc软件自身进...
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Seqkit小工具处理序列、提取序列IDSeqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。 优点1.能够非常全面的处理fasta/q文件，运行速度超快的序列工具...
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Motif / Domain / Gene familyMotif Motif 是超二级结构α+β组成， Domain 与其他区域相对独立，仅有一处相连，domain可以由几个motif形成。一个基因转录的蛋白质分子中可以包含多个...
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【科研相关】使用PPT进行科研绘图(一)写在前面 PPT堪称是个神器，不仅能做presentation，还能做Figure，而且上手还容易，毕竟大多数人从初中甚至小学就开始接触了。我就利用封控期间，学习了一下...
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【科研相关】有机化合物的系统命名法
写在前面 最近由于课题需要，接触了些有机化合物的结构式，我首先想弄明白的是，它的编号是怎么来的，搜索了一下优质内容。花了半小时看完以后，仿佛回忆起自己高中和本科学过的那...
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orthofinder安装及使用教程安装orthofinder 使用conda安装 安装软件前，先设置一个小环境，不要直接在自己账户的当前环境内安装软件；你可以创建很多小环境名，有的小环境坏了，你不要就可以了...
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phylosuite提取叶绿体蛋白编码基因构建Ml树1.利用phylosuite软件根据NCBI号提取genbank格式的序列文件 file--input file...or ID(s) ---在input by IDs 处粘...
