比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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比较基因组学分析2：基因家族收缩与扩张分析 -
比较基因组学分析3：特异节点基因家族富集分析（非模式物种GO/KEEG富集分析）比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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节点、cpu、cpu核、进程、线程
1. 一个CPU有多个核心（物理核心），接触到的服务器叫做节点，一个节点也可以有1-多个CPU，1个CPU有多个CPU核心，大多数计算服务器都是2个CPU的。 进程：进程是程...
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不积跬步，无以至千里。
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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群体遗传学习笔记-基础知识
群体遗传学介绍 传统群体遗传学是基于观察到的等位基因频率与预期频率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能会看到有性繁殖的二倍体个体群体，而且这些种群没有重叠...
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SRA下载数据及转化为fastq方法可参考https://www.jianshu.com/p/0694fcb77157[https://www.jianshu.com/p/0694fcb77157]的四种下载方...
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服务器设置使用的最大内存
通常一个节点的内存在250G左右，若不设置运行内存，则会默认250G，当设置核心数过少时，可能会被分配到某个含空闲核心数不多的节点，该节点内存亦不多，因此可能会导致任务被杀死...
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查看cpu使用情况
一、总cpu使用查看 Linux中Swap（即交换分区）：类似于Windows的虚拟内存，就是当内存不足的时候，把一部分硬盘空间虚拟成内存使用,从而解决内存容量不足的情况。A...
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生信阿拉丁，为实用而生
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两台服务器间的数据传输方式
两台Linux服务器[https://www.zhihu.com/search?q=Linux%E6%9C%8D%E5%8A%A1%E5%99%A8&search_sourc...
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测序中Q20 Q30 Q40
二代测序中，每测一个碱基会给出一个相应的质量值，这个质量值是衡量测序准确度的。碱基的质量值13，错误率为5%，20的错误率为1%，30的错误率为0.1%。行业中Q20与Q30...
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关于K-mer
1.什么是K-mer? mer: 分子生物学领域中意义为：monomeric unit ( mer) ：单体单元，相当于nt或者bp。通常用于双链核酸中的单位，100 mer...
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测序Q20，Q30介绍
高通量测序中每测一个碱基都会给出一个对应的质量值，这个质量值是衡量测序准确度的，20的错误率为1%，30的错误率为0.1%。行业中Q20与Q30则表示质量值≧20或30的碱基...
