参考资料链接 https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tree/v1.0.1[https://github.com/cx...
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基于云服务器上的Centos7.6版本安装docker step 1：安装必要的一些系统工具 出现 完毕 就说明成功了。Step 2: 添加软件源信息 出现 完毕 就说明安装...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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对peak进行功能注释的GREATGREAT是一款peak区间进行基因注释的工具，除了给出peak对应的基因外，还集成了多种基因的功能分析，网址如下 http://great.stanford.edu/pub...
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从gtf提取ENSEMBL ID和transcript ID以及SYMBOL对应关系做可变剪切分析时，会依次进行基因水平和转录本水平的差异分析，最后通常需要进行ENSEMBL ID和 transcript ID (ENSEMBLTRANS)以及gene sy...
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转录组DEGs聚类热图和功能富集分析写在前面：经常做转录组分析，就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择，能直观比较各种处理带来的影响，如下： 来自Nature ...
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转录组分析5——差异表达分析差异表达分析内容：• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts，RPKM，FPKM，TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom，edge...
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根据基因组fa文件和gff文件提取cds并翻译成pep
cds文件：注释信息里的蛋白编码序列pep文件：cds对应序列翻译成的氨基酸序列从NCBI上下载基因组时，有的并没有上传cds文件和pep文件，此时该怎么办呢？ （1）利用脚...
