2018年6月Nature Methods上发表了一篇关于机器学习分析特定基因集内部关系工具的文章,简单来说就是,通常我们做了差异基因分析得到一个基因集合,然后会用GO/KE...
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我们提出了Augur,一种在单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型进行优先排序的方法。Augur采用了一个机器学习框架来量化高维空间中扰动细胞和未扰动细胞的可分离性。我们在单...
说在前面 Immugent在前段时间的一篇推文中:SciBet:一个软件解决单细胞注释所有烦恼[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
单细胞转录组测序技术的普及,为生命科学的研究提供了全新的手段。基于高通量单细胞转录组测序,既能发现特定组织中可能的细胞类型,也能了解不同细胞组成上的差别,更能通过基因表达图谱...
并不觉得ggplot2作图多好看,尤其是箱线图和柱状图需要大量的修饰,现在介绍ggplot2做分组箱线图,添加箱子的bar和均值的几个函数 stat_boxplot() 函数...
WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[https://www.jian...
论文 Pan-African genome demonstrates how population-specific genome graphs improve high-t...
适用背景 在单细胞分析中,必要的一步是对每个细胞进行注释,这相当于给每个细胞打个标签,或者说起个别名,这些信息都存在@meta.data信息里,所以不用特意去更改细胞名字,S...
常见问题: 1)Seurat CCA整合分析后什么情况下用RNAassay,什么时候用intergratedassay? conserved cell type marker...