一、举例回顾 本节所使用GSE1009数据集，已经用limma包进行差异分析，现对DEGs做GO富集分析。 GSE1009数据集介绍： 样本量：共6个样本，其中后3个为糖尿病...
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15.KEGG富集分析R语言代码及5种图的绘制 -
s'###'就不用转义了
Linux环境变量PATH的增添和删除操作
Linux设置环境变量 我在linux系统中执行ifconfig命令，显示无法执行，说什么不在PATH中无法定位，所以无法执行。所以我们就要把ifconfig的路径加入到PA...
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遇到了同样的问题， 可以看最新文档https://satijalab.org/signac/articles/pbmc_vignette.html
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一个扩展功能R包，可以用来分析、解释和探索单细胞染色质数据集。目前，Signac包主要专注于分析单细胞ATAC-seq数据，之后还会添加其他基于染...
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使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一个扩展功能R包，可以用来分析、解释和探索单细胞染色质数据集。目前，Signac包主要专注于分析单细胞ATAC-seq数据，之后还会添加其他基于染...
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写的真好。。
单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法
单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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要加油呀~
这样的结果,算不算失败？
今天的一天差不多都在思考等待中度过，为的是想引导那个年轻人改变固有的思维成为更好的自己。可是，发觉我错了。年轻人连跟我再次见面的机会都不愿意给我，他觉得没有必要，更不用说敞开...
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@周运来就是我 看到了，最小生成树的节点
scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教程
拟时（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，在发育相关研究中使用频...
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请问轨迹分析以后得到的Y_1,Y_2...Y_n是轨迹上的坐标吗？
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将Shiny APP搭建为独立的桌面可执行程序 - Deploying R shiny app as a standalone application起源！ 某天，我发现了Shiny这个东西，当时兴冲冲的尝试官网上各种各样的例子，最后发现这个东西似乎只能充当一个“玩具”。如果要在本地运行，它需要一个完整的R环境，这对相当一...
