win10的powershell可能不用安装ssh （可能自带的，取决于个版本的win10）.
如果是在计算节点上运行。用powershell输入ssh -N -f -L localhost:8888:cu015:8888 john@111.111.1.1以及密码和二次验证密钥后，会卡住（看起来向卡，实际上输出都在job.%j.out里面）。但是notebook 可以打开。而且我日志文件里面显示的是“http://node2:8888/”
实际上输入浏览器的地址仍然应该是是“http://localhost:8888/”或“http://127.0.0.1:8888/”
在服务器或超算集群上使用jupyter notebook在普通服务器上 一般如果不需要集群的话，可以参考anaconda的说明[https://docs.anaconda.com/anaconda/user-guide/tasks...
在普通服务器上 一般如果不需要集群的话，可以参考anaconda的说明[https://docs.anaconda.com/anaconda/user-guide/tasks...
在普通服务器上 一般如果不需要集群的话，可以参考anaconda的说明[https://docs.anaconda.com/anaconda/user-guide/tasks...
相信大家在R脚本中都写过以下代码： 以及 第一段脚本是指定包的安装路径，第二段是指定安装源的国内镜像。每个文件这样指定是比较麻烦的。其实这些都不用特殊指定，只需要通过编辑RP...
Jellyfish is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. Jellyfish can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in a binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command, or queried for specific k-mers with "jellyfish query". See the documentation for details.
If you use Jellyfish in your research, please cite:
Guillaume Marcais and Carl Kingsford, A fast, lock-free approach for efficient parallel counting of occurrences of k-mers. Bioinformatics (2011) 27(6): 764-770 (first published online January 7, 2011) doi:10.1093/bioinformatics/btr011
Jellyfish-2的安装与使用说在前头 啥是kmer？ kmer就是一条长度为kbp的DNA string。 Jellyfish有啥用？ 计算输入的基因组数据（fasta）、测序数据（fastq）等，长度...
find . -name "*" -type f -exec mv {} ./mid_file \;
什么意思？把当前目录下所有文件放到mid_file中？然后所有文件都丢失了？
全长转录组分析-小麦前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据，参考了网上许多流程，收获良多，在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术（SMRT cell）,凭借超长读长的...
SRA数据下载 近期下载SRA数据，应用linux子系统下载极其不顺利。果断放弃，下面介绍两种亲测好用的办法。 方法1 windows下使用SRA Toolkit下载 首先在...
另保存为Excel 97-2003版本的，可以读入。
libxls error: Unable to open file整理一个报错，使用readxl包读取xls文件代码 报错： 不需要改代码，打开xls文件另存一下，重新使用代码读取就行了。
