ncbi中，gene序列是连续的，如下图1..3380，而mRNA是基因的cDNA，序列是一样的，但是是经过剪切掉，只留下外显子(1..349,604..1266.1353....
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NCBI中gene和mRNA和CDS区别 -
MCScanX安装与使用 (2022)为什么要写这篇文章：最近因为需要用到MCScanX画两个物种的共线性点图，但是发现搜到的blog中所提供的安装方法都不太相同，且在都会出现或多或少的问题，另外搜到的所有blo...
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KaKs_Calculator2.0+ParaAT计算两个物种间的Ka/Ks
1.软件安装 ⭐KaKs_Calculator2.0⭐ParaATKaKs_Calculator2.0[https://sourceforge.net/projects/ka...
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比较基因组学之共线性工具JCVI安装及使用比较基因组学之共线性工具JCVI安装及使用 jcvi及依赖的安装 $ conda create -n jcvi -c bioconda -c conda-forge jcvi...
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如何用WGDI进行共线性分析(下)
在上一篇教程的最后，我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak，基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题，为什么我们可以根据peak来推断多倍化时间？在Lynch和C...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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CDS只包括起始密码子到终止密码子之间的序列，而cDNA还会包括UTR.
gtf文件第三列详详解（exon/CDS transcript/gene）
AAH2基因的一个转录本（是﹣链，所以起始密码子位置在后面） 1. exon外显子：包括cds，并不是所有的外显子都能编码氨基酸，5‘UTR 3'UTR，外显子可能在一些转录...
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系统发育（Phylogeny）简介重建系统发育关系=分子数据建树？ 一提到phylogeny，我们的第一反应就是分子数据建树。这种理解是片面的，但也反映了一些它的分类学的区别： 首先，分类学在根据charac...
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一条小咸鱼
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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如果你是程序员，或者有一颗喜欢写程序的心，喜欢分享技术干货、项目经验、程序员日常囧事等等，欢迎投稿《程序员》专题。 专题主编：小彤花园 http://www.jianshu.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序员】专题拒稿指北：http://www.jianshu.com/p/7c8b33b5f63b 投稿须知： 1.收录相关技术文章，但不限于技术，也可以是项目经验类的文章和程序员日常。 2.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。你可以将这些推广以及个人信息放在个人主页介绍里。 3.字数极少，段落混乱，大段代码没有放到代码框的文章不收录 4.不相关的内容不收录，请确认文章内容和本专题相关 目前针对优质作者及爱好者，开设了官方程序员微信群，希望加入请发简信给主编小彤花园索取个人微信，主编会将你加入到【程序员】微信群，分享内容，收获知识。添加微信时备注昵称。
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运用 R语言 pheatmap 包绘制热图基础部分运用 R语言 pheatmap 包绘制热图（基础部分） 注意内容： 对绘图文件格式的说明 对数据处理的说明，这里的数据是物种属水平相对丰度表 对pheatmap包基本绘图参数...
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ggplot2超详细讲解一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attribute...
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高通量测序中，read、contig和Scaffold分别是什么
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig？ 拼接软件基于reads之间的overlap区，拼接获得的序列称为Contig（重...
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【动植物研究动态】20220722文献解读
Science | 农科院作科所周文彬：水稻中转录因子OsDREB1C同时提高光合作用效率和氮素利用效率[https://mp.weixin.qq.com/s/Pul-HUe...
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图位克隆的方法、过程及优缺点
举例说明图位克隆的方法、过程及优缺点 该方法分离抗病基因首先要构建一个覆盖目的基因区域的精密分子标记遗传连锁图，以此为基础进一步制作覆盖目标基因区域的物理图谱，获得包含目的基...
