为什么要写这篇文章:最近因为需要用到MCScanX画两个物种的共线性点图,但是发现搜到的blog中所提供的安装方法都不太相同,且在都会出现或多或少的问题,另外搜到的所有blo...

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1.软件安装 ⭐KaKs_Calculator2.0⭐ParaATKaKs_Calculator2.0[https://sourceforge.net/projects/ka...
比较基因组学之共线性工具JCVI安装及使用 jcvi及依赖的安装 $ conda create -n jcvi -c bioconda -c conda-forge jcvi...
在上一篇教程的最后,我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak,基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题,为什么我们可以根据peak来推断多倍化时间?在Lynch和C...
AAH2基因的一个转录本(是﹣链,所以起始密码子位置在后面) 1. exon外显子:包括cds,并不是所有的外显子都能编码氨基酸,5‘UTR 3'UTR,外显子可能在一些转录...
重建系统发育关系=分子数据建树? 一提到phylogeny,我们的第一反应就是分子数据建树。这种理解是片面的,但也反映了一些它的分类学的区别: 首先,分类学在根据charac...
运用 R语言 pheatmap 包绘制热图(基础部分) 注意内容: 对绘图文件格式的说明 对数据处理的说明,这里的数据是物种属水平相对丰度表 对pheatmap包基本绘图参数...
一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attribute...
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重...