归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
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人类参考基因组有多个版本,在分析中,我们可能会用到不同的版本,抑或有事我们得到的bed、bam或者vcf文件并非我们想要的参考基因组的,这时便可以通过CrossMap进行坐标...
1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1)按分型百分比条件过滤,多数文章剔除缺失率在20%以上的位点,样本量较大的群体中,可以将缺失率小于50%的位点都保留;• ...
BUSCO - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 额。直译的话就是普遍通用的单拷贝直...
基因组组装 基因组组装一般分为三个层次,contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
最近在研发安全用药相关产品,查找了很多的数据库,PharmGKB是史上唯一一个收集最完整的与药物基因组相关的基因型和表型信息,并将这些信息系统地归类的数据库。PharmGKB...
首先,基因本体论(Gene Ontology)和基因文库不是同一概念。 我从下面几个方面讲一下GO的一些概 念和基本方法(感谢刘老师提供的资料): 1. Ontology(本...
三种方法如何获取snp信息 引用: http://www.bio-info-trainee.com/2100.html#more-2100 有研究表明STAT4上的rs757...