●英文题目《Whole-genome resequencing reveals world-wide ancestry and adaptive introgression ...
发简信
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2022-08-20 | 全基因组重测序揭示东亚驯化牛的全球祖先和适应性渗入事件 -
全基因组重测序流程【超细致！！】
自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据，在做的过程中参考了很多资料，现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家，一些关键环节已经帮大家踩过坑了，相信跟着学习实践一定能够收获...
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「博客翻译」SNP过滤教程（一）原文地址: SNP Filtering Tutorial 感觉文章写的真棒，于是就翻译了一遍 目标 学习如何使用VCFtools根据缺失信息，基因型深度(genotype d...
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关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可以防止calling一些假阳性...
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10.16 梳理SNP calling过程
之前跟着流程过了一遍，使用： E.coli_K12_MG1655.fa 为参考基因组， SRR1770413_1.fastq.gz SRR1770419_1.fastq.gz...
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群体遗传学一-SNP calling
使用BWA+samtools+gatk4.0进行SNP calling 首先下载数据eg： 01.align 首先定义相关用到的变量，然后使用baw创建索引之后进行map。 ...
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GATK4流程学习之DNA-Seq variant calling(Germline：SNP+INDEL)GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803755fa6]GATK4流程学习之DNA-Seq varia...
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基因流分析——Treemix基本概念： 基因流（也称基因迁移） 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非...
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群体结构分析 | Pophelper 的“平替版”写在前面 终于到了这一天，我又捡起了七八年做群体分析的技能....只是那会我画图就用 ggplot2，而现在我只用「TBtools」。基于重测序数据的群体结构分析，很多时候，...
