在四周之前，我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗？，于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结束了，我对这个计划进行一个阶段性的总结。 答疑解惑 首先要感...
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「学转录组入门生信」四周实战总结 -
以水稻为例教你如何使用BSA方法进行遗传定位（上篇）BSA虽然不是我最早接触的高通量数据分析项目（最早的是RNA-seq），但是却是我最早独立开展的数据分析项目， 我曾经专门写过一篇文章介绍如何使用SHOREMap做拟南芥的E...
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StringTie + DESeq2 进行 RNA-seq 差异基因分析按：RNA-seq 流程非常多样化，每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值，DESeq2 分析差异基因。这里把...
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2019-10-03-学习RNA-seq这十年记录学习生信技能树的RNA-seq这十年（3万字长文综述） 首先是目前10年来测序技术的的发展平台的更迭变化 我摘抄了重点的内容关于不同读长方式测序结果的优缺点比较如下 短读长、...
