一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
发简信
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算 -
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生信软件的使用：fastacmd的提取较大基因组序列
写在前面： 最近要将参考基因组(4.1G，粗山羊草)的每一条染色体单独提取出来，之前我写过一个使用faSomeRecords的帖子基因组学5-利用faSomeRecords根...
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生信软件的使用:bwa-mem2小测试
写在前面 最近在利用小麦的重测序数据进行mapping，小麦是一个很奇特的物种，六倍体，有ABD三个基因组，基因组大小约为17Gb，因此，制约小麦重测序数据分析的一个很大的问...
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生物转生信，流程之外有天地，分享生信有关的文献，技巧等一切与生信有关的主题。
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基因组学5-利用faSomeRecords根据基因ID提取基因序列安装 从该网址下载其安装脚本：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/ 我一般都是保存在bin目录下，cd...
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生信软件的安装1-SRAtoolkit写在前面 最近服务器的我最常用的那个节点又坏了，那个环境我搭建的很好，几乎所有数据和软件都在那上面。但是，无奈之下只能换到另一个节点，一切都要从头再来，就包括安装软件，事已至...
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单个基因的生物信息学分析(2)-蛋白质结构域预测本期的主题仍然属于《单个基因的生物信息学分析》，主要讲解介绍一下单个蛋白质结构域分析。 网站链接如下：InterPro 打开主页面显示如图1，注意的是，一次只能进行一个蛋白序...
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单个基因的生物信息学分析(1)-基因结构与功能分析在生物学分析中，我们经常会针对某个基因进行生物学功能分析，比较常见的包括基因结构预测，功能注释，蛋白质结构域预测（跨膜域，信号肽），同源基因分析，多序列比对，亚细胞定位预测，...
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植物基因组学-fastp进行高通量测序数据的质控对于各位小伙伴来说，无论是自己独立进行高通量测序数据分析，还是解读公司的测序结果，一个必须要面对的情况就是高通量测序数据的质量控制，又称Quality Control。照顾到...
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植物基因组-基因组分析中的“地图”文件(gff3和gtf文件介绍)常见的生物信息分析中，基因组的注释文件和参考基因组具有相同重要的功能，如果说参考基因组是一个蕴含着所有资源的宝岛，那么基因组的注释文件就是航海路线图。因此，理解基因组注释文件...
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植物基因组学-专属于小麦的测序数据库IWGSC今天将为大家介绍小麦的特有的生物学网站，该数据库是由国际小麦基因组测序联盟(International Wheat Genome Sequencing Consortium,...
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植物基因组学-小麦基因组数据介绍以及获取小麦是世界上最重要的粮食作物之一，随着新一代测序技术的发展，小麦的基因组学发展迅速。本文主要介绍小麦常用的基因组数据库以及基因组数据库下载，方便为从事小麦研究的同学提供一...
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有一个问题，如果我时行分割没有空格的一个字符串，该怎么办？我有一行数据是“aaaaaa”，怎么进行分割呢
python split() 方法
本文讲述的是string.split(s[, sep[, maxsplit]])，针对string类型的split()函数。它主要是切割字符串，结果返回由字符串元素组成的一个...
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生信技能树，生信菜鸟团，jimmy
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