关于limma包差异分析结果的logFC解释 http://www.bio-info-trainee.com/1209.html 首先，我们要明白，limma接受的输入参数就...
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表达矩阵log后进行差异分析 -
找不到某些GEO数据的表达矩阵肿么办举个栗子，GSE99410和GSE78200。 代码看起来没有问题，怎么就画不了图？ 因为它是空数据啊。 有两种情况 第一类，不是芯片数据，用于后续分析的文件以其他形式存储了...
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如何把从TCGA下载的HTseq count转换成FPKM如果你下载了TCGA数据库里的count数据，想把它转换成FPKM应该怎么做呢？参考文章：１．Htseq Count To Fpkm ２．【原创】R语言实战：read cou...
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WGCNA学习笔记本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团：一文学会WGCNA分析2.WGCNA（加权基因共表达网络分析）3.WGCNA分析，简单全面的最新教程4.WGCNA实战练习5.STEP6:W...
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如何将WGCNA导出的基因共表达网络进行可视化（cytoscape软件的使用）WGCNA分析过程中，你可以得到edge和node的文件，里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值，根据这些值你可以将它们之间的...
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CIBERSORT 免疫浸润(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...
