欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPpeakAnno是一个bioconductor上的R包，针对peak calling之后的下游分析，提供了以下多种功能 查找与peak区域...
发简信
IP属地：福建
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使用ChIPpeakAnno进行peak注释
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ChIP-seq实践（非转录因子，非组蛋白）在实战之前，首先对CHIP-seq分析做一些了解，以下是从各个地方copy过来综合起来的，有些散乱，是我认为重要以及应该了解的知识点。chip-seq 实战就跟在转录组和外显...
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我的ChIP-Seq(4):MAnorm差异分析哈哈，搜了一圈没发现网上有关于MAnorm的中文教程或者是说明，本文将是第一篇~撒花✿✿ヽ(°▽°)ノ✿那就要用心写了，感到鸭梨.jpg== 首先，MAnorm是什么，可以做...
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制作U盘启动盘，CentOS系统安装笔者以前没重装过系统，大学太懒了，连windows系统也没重装过，公司要用CentOS7作为服务器，让我拿一台旧机重装下Linux系统，今天写下安装步骤，如有坑和不足之处，还...
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ChIP-seq数据分析（一）：从raw reads到peaks开篇致谢：下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的，链接：https://www.bilibili.com/video/av29...
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deepTools 的使用（一）官方参考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下载安装 python ...
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ChIP-seq分析的数据标准
以下罗列了ChIP-seq数据分析中的ENCODE标准，针对不同的免疫共沉淀类型有不同的标准，以下从组蛋白和转录因子2个方向介绍： 一、组蛋白 生物学重复： 至少2个 抗体：...
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【Bioconductor系列】如何用Bioconductor对基因组注释
这一次，我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题，为什么要进行基因注释。就我目前而言，它用来解决如下问题： 在mapping-by-sequencing的时候，我找到了一些可...
