颤抖吧__小虫子

转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点： 速度快 准确度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多个比对共享...

生信师姐

seurat 涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神们分享的帖子，来梳理一下。 一、读入数据。 Read10X(...

whitebird

年底复盘，发现很多知识点理解并不深入，想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响，我们需要对单细胞counts矩...

汪汪队队长_莱德

写在前面：今天突然想写这个教程，花了一下午看资料，其实我前面是有一些基础的，但是看的还是会很乱，所以想把这个包的脉络写一下，希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...

BINBINCC

在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...

Hayley笔记

1. 数据下载 在读Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...

Hayley笔记

1. 简介 EndMT是指在多种刺激因素作用下，内皮细胞失去其原有特征并向间充质细胞进行转化（肌成纤维细胞、平滑肌细胞等）的过程，其结果是ECs在极性、形态和功能等方面发生重...