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Cellranger 5.0系列之二——学习如何运行Cellranger 5.0的multi 流程此流程比之前的cellranger pipeline相对复杂一些。Cellranger multi可以同时运行转录组数据和免疫组库数据。欢迎讨论。 使用cellranger ...
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10X 3‘和5’基因表达文库有何不同？关于10X 公司3‘和5’基因表达文库的差异，官方给出的解释如下： 这两者很相似，但在最终的文库中，捕获的是不同的多聚腺苷酸化转录本末端。两种方案都使用了polydT引物用于...
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Cell Ranger 5.0系列之一——Cell Ranger 5.0 官方更新说明笔记
2020.11.19 Cell Ranger更新到了5.0版本。官网的更新说明包括以下三个部分： 一、关于基因表达和Feature Barcode分析的更新 •Cell Ra...
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运行clono_seurat<- subset(clono_seurat,cells = rownames(bcr))这一行，出现下列报错：
Error in CellsByIdentities(object = object, cells = cells) :
Cannot find cells provided
不知道是什么原因？单细胞免疫组库数据分析||Seurat整合单细胞转录组与VDJ数据
在做10X单细胞免疫组库分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘转录组，那么怎样才能把两者结合到一起呢？ 今天我们尝试用我们的趁手工具做一下整合分析。 首先是下载数据...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
