01 题目 :Potential drug targets for multiple sclerosisidentified through Mendelian random...
发简信
IP属地：云南
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发文新方向：11+高分药靶孟德尔随机化联合共定位 -
高分SCI必须掌握国自然这一热点：孟德尔随机化+肠道菌群随着对肠道菌群在人类健康中的重要性认识的逐渐加深，越来越多的研究者开始关注肠道菌群孟德尔随机化（Gut Microbiota Mendelian Randomization，...
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ChIP-seq下游分析之motif 分析什么是ChIP-seq？ ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）与二代测序技术的结合，通过染色质免疫共...
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单细胞文章复现丨单细胞测序揭示肺腺癌中不同的肿瘤微环境模式文章标题 Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in l...
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干货分享|使用ssGSEA分析肿瘤浸润免疫细胞上次的干货分享我们给大家介绍的是如何利用TIDE预测肿瘤免疫逃逸（推文链接），本期推文更加重磅，我们将给大家详细讲解生信文章免疫分析必做的——肿瘤浸润免疫细胞。 在学习肿瘤浸...
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1区SCI新宠丨生信分析+孟德尔随机化强强联合上大分！！！生物信息学联和孟德尔随机化（Mendelian Randomization，MR）是一种最新流行的研究方法，结合了生物信息学和遗传学的优势，旨在深入探究单个遗传风险评分（Ge...
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干货分享|利用TIDE也能预测肿瘤免疫逃逸说到免疫检查点阻断疗法大家应该都不陌生，其中，最富盛名的免疫检查点就是PD-1/PD-L1了。表达在T细胞表面的程序性死亡受体（PD-1），与表达在肿瘤细胞表面的程序性死亡配...
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NHANES数据库怎么学？NHANES数据库怎么学？[https://mp.weixin.qq.com/s/XLCUFNQJEXd-UCrrAiZMbw] 国家健康和营养检查调查(NHANES，Nat...
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重症医学领域的发文利器“MIMIC”还有谁不知道！！！重症医学领域的发文利器“MIMIC”还有谁不知道！！！[https://mp.weixin.qq.com/s/BugUfK5cfihGhz_QERxPCw] 对于临床医生来说...
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多组学水平的孟德尔随机化分析+three-step SMR 应用实操
多组学分析：在基因表达、表观遗传、蛋白、单细胞及微生物组学等水平上，利用组学数据比较不同组学水平的疾病和健康对照，从而鉴定潜在的致病机制。 药物靶点孟德尔随机化分析：探究是其...
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什么！绘制桑基图也有傻瓜式的操作啦？教你提升Figure的丰富度！在生信文章中，我们经常会见到看起来很赛博朋克的桑基图——丰富色彩的虚实结合，高级感满满。如图1，一些ceRNA网络相关的文献就会用桑基图来直观的展示lncRNA、miRNA、...
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详细解读！利用ieu数据库进行GWAS-GWAS共定位分析通过孟德尔随机化分析，确认了两个疾病或性状的因果关联并且找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点是如何影响这两个表型的。常见的一个解释方法是共定位分析。 共定位分析通常用于鉴...
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表观遗传学结合转录组的多组学研究在癌症诊断和治疗中的应用表观遗传学包括在不改变 DNA 序列的情况下染色质的可遗传结构和生化改变 。表观遗传机制通过改变局部和全局染色质的表观遗传密码的可及性来调节相关基因表达，从而操纵各种生理和病...
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两大经典数据来源，带你轻松搞定蛋白质组学！
前面的推文（多组学联合应用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
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保姆级教程！5分钟学会绘制timeROC、multiROC（附示例数据）！文献中常见的ROC曲线有两种，一种是多时间点ROC（timeROC），是不同时间点下的ROC，最常见的为1、3、5年，如图1；一种是多指标ROC（multiROC），是不同变...
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PheWAS+GWAS直冲一区9+SCIPheWAS，全表型组关联分析(又称反向GWAS)，是考察全表型组范围所有表型与某一SNP之间的关联的方法。其主要是为了弥补GWAS在全基因组范围发掘基因多效性方面的不足(G...
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手把手教你从GSEA下载目标基因集并使用maftools包绘制瀑布图！很多情况下，我们进行生信分析都会有一个感兴趣的点，可以是免疫、m6A甲基化、铁死亡、铜死亡等等，但有很多小伙伴不知道到哪里去寻找并下载目标基因集。本期推文，小碗不仅会给大家介...
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两样本孟德尔随机化代码实操
前面给大家介绍了孟德尔随机化的概念和它所包含的内容以及一些注意事项，忘记的同学可以复习一下哦（一文带你读懂孟德尔随机化 - 简书 (jianshu.com)[https://...
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基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学——多组学联合应用，你知道多少？各位小伙伴大家好，今天给大家分享的是我们经常听到的一个名词——组学，包括我们所知道的基因组学、转录组学、蛋白组学以及代谢组学等。“组学”这个词字如其面，也就是说我们研究的是一...
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学森林图？看这篇就够了！在之前的推文（单因素、多因素COX回归分析在R中的实现与常见问题解答 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0fa217a...