在生信文章中，我们经常会见到看起来很赛博朋克的桑基图——丰富色彩的虚实结合，高级感满满。如图1，一些ceRNA网络相关的文献就会用桑基图来直观的展示lncRNA、miRNA、...
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什么！绘制桑基图也有傻瓜式的操作啦？教你提升Figure的丰富度！ -
多组学水平的孟德尔随机化分析+three-step SMR 应用实操
多组学分析：在基因表达、表观遗传、蛋白、单细胞及微生物组学等水平上，利用组学数据比较不同组学水平的疾病和健康对照，从而鉴定潜在的致病机制。 药物靶点孟德尔随机化分析：探究是其...
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两大经典数据来源，带你轻松搞定蛋白质组学！
前面的推文（多组学联合应用···[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2ODk3NDkxOA==&mid=2247484306&idx=1&...
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保姆级教程！5分钟学会绘制timeROC、multiROC（附示例数据）！文献中常见的ROC曲线有两种，一种是多时间点ROC（timeROC），是不同时间点下的ROC，最常见的为1、3、5年，如图1；一种是多指标ROC（multiROC），是不同变...
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手把手教你从GSEA下载目标基因集并使用maftools包绘制瀑布图！很多情况下，我们进行生信分析都会有一个感兴趣的点，可以是免疫、m6A甲基化、铁死亡、铜死亡等等，但有很多小伙伴不知道到哪里去寻找并下载目标基因集。本期推文，小碗不仅会给大家介...
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单因素、多因素COX回归分析在R中的实现与常见问题解答在生信分析的过程中，单因素、多因素COX回归分析常用来筛选与患者预后有关的因素，相信很多小伙伴对此并不陌生。那么，如何在R中进行单因素、多因素COX回归分析？COX回归分析与...
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GEO2R的limma差异分析流程【芯片microarray数据】附limma+RNAseq参考学习GEO提供的GEO2R在线差异分析工具使用的代码流程。笔记里的代码在理解每一步的基础上，部分做了修改。但大致思路不变，即使用limma包对芯片测序数据进行差异分析(暂...
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实战-TCGA数据的NMF聚类和可视化0.NMF NMF是非负矩阵分解，也是常用的划分亚组（亚型）的聚类方法之一咯。 代码主要参考了帮助文档和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
