samtools view [options] input.file input.file : 可以是sam、bam、或者其他相关格式，输入文件的格式会被自动检测默认输出内容...
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【基因组学】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化，因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例，介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。 一.下载 下载链...
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重测序分析（2）原始数据的质控和过滤fastq数据格式 第一行：描述信息（包括表头、芯片 ID、第几个通道、识别碱基）第二行：读取碱基第三行：+第四行：碱基质量分数，每个字符对应第二行相应位置碱基或氨基酸的质量...
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重测序分析（1）软件安装
今天开启重测序分析专题啦！恳请各位观众老爷点点关注！ 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软件非常多，本节介绍重测序常用软件的安装方法。 安装R包 使用...
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测序数据比对到参考基因组基因课FTP地址：ftp://http://gsx.genek.tv/2020-3-10%E7%9B%B4%E6%92%AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%...
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每个人都是生活家 1.生活家收录范围：美食、美妆护肤、穿搭、手工手账、旅行攻略、购物指南以及测评、宠物植物、育儿指南、家装指南、运动健身（非专业）、健康养生、及其他贴近生活的兴趣爱好 所有让生活变得更好的技能和经验，（比如教你p照片，记录瘦身过程等）纯粹生活感悟不收 2.内容原创、鼓励从生活中的自身经验发掘生活的美好与乐趣，鼓励图文并茂。 3. 文内不得出现个人推广性质的额外链接，例如微信号，微博。更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。 专题主编： 迷蝴庄生 http://www.jianshu.com/u/257421ea813e 简书生活家微信群已建立，加入请添加有爱的生活家小助手微信Hedy3680（欢姐），拉入群。添加请备注“我爱生活家”。 关注简书官方微信公众号（jianshuio），及时阅读简书热门好文。
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全基因组重测序流程【超细致！！】
自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据，在做的过程中参考了很多资料，现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家，一些关键环节已经帮大家踩过坑了，相信跟着学习实践一定能够收获...
