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    samtools: view

    samtools view [options] input.file input.file : 可以是sam、bam、或者其他相关格式,输入文件的格式会被自动检测默认输出内容...

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    【基因组学】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果

    写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化,因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例,介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。 一.下载 下载链...

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    重测序分析(2)原始数据的质控和过滤

    fastq数据格式 第一行:描述信息(包括表头、芯片 ID、第几个通道、识别碱基)第二行:读取碱基第三行:+第四行:碱基质量分数,每个字符对应第二行相应位置碱基或氨基酸的质量...

  • 重测序分析(1)软件安装

    今天开启重测序分析专题啦!恳请各位观众老爷点点关注! 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软件非常多,本节介绍重测序常用软件的安装方法。 安装R包 使用...

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    测序数据比对到参考基因组

    基因课FTP地址:ftp://http://gsx.genek.tv/2020-3-10%E7%9B%B4%E6%92%AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%...

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    全基因组重测序流程【超细致!!】

    自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据,在做的过程中参考了很多资料,现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家,一些关键环节已经帮大家踩过坑了,相信跟着学习实践一定能够收获...